因为中国人最常接触的印欧语系和汉藏语系是这样，于是就想当然地以为全世界都是这样。

印欧语系中这种叫法由来已久，拉丁语的爸爸妈妈分别是pater和mater，梵语（经我百度）是pitri和matri，古高地日耳曼语（据韦氏英语词典词源部分）是fater和muoter，古希腊语（同样据韦氏词典）是patēr和mētēr，可见类似pa和ma这样的音素应该可以上溯到这几种古代语言共同的祖先，也就是原始印欧语。

汉藏语系我不很了解，不过楼上几位说中国古代不叫“爸妈”而叫“父母”、“爹娘”的应该是有所偏颇，据我所知（出处不详请自行百度）“父母”这两个字古代就是读ba（或pa）和ma的。

如果放眼其他语系的话就没有这么整齐了。

日语的爸爸是ちちchichi或者とうさんtosan（我也不知道罗马字是不是改这么写，欢迎指正），妈妈是ははhaha或かあさんkasan，相差很大吧。

阿尔泰语系请参见@Hasuran Li的答案。

顺便推荐一下一首蒙古语歌叫《梦中的额吉》。